La razón por la que la araña pierde sus poderes es la parte más desconcertante de la película. Intentaré explicar mi opinión sobre esto mirando tu guión paso a paso.
En la película, vemos a un Spider-Man relativamente joven (las personas que lo salvaron de una pelea en un tren comentan que sigue siendo un niño) que, a pesar del nivel de coeficiente intelectual mostrado en Spider-Man 2 (por reconocer un error en la proyección inicial de Doc Ock), sigue sin ser un tipo financieramente seguro, porque está en la escuela repartiendo pizza (que no es un trabajo perfecto cuando hay problemas en la ciudad) y, a diferencia de Batman, no hay ningún Lucius Fox o Alfred en su vida para ocultar su apariencia o manejar el lado financiero de su vida cuando es conserje.
Debido a que él es el conserje, su relación con MJ en la película es tensa al principio, y ella finalmente se dedica a otra persona. Además, la carga de la muerte de su tío parece pesarle hasta que confiese la verdad a su tía. Además, las mismas fotos que tomó para su trabajo lo mostraron como el villano del Daily Bugle. Todo esto es el resultado de la tensión que le hace dudar de su propia fuerza y propósito, lo que le lleva a la decisión de dejar de ser un héroe.
Una vez que toma una decisión, probablemente no podrá controlar sus poderes como lo hace normalmente cuando cree más en sus habilidades y en la responsabilidad que conlleva, lo que le llevó a perderlos.